石头上有贝壳存在的原因有多种：

1. 贝壳作为一种生物，会随海洋生态体系中的各种环境因素发生周期性变迁。在潮涨潮落等水流运动中，许多贝类可能会被冲刷到海岸上。它们在沉积的过程中会逐渐依附在石头表面甚至逐渐生长繁殖，最终在石头表面形成贝壳结构。经过一定的时间后，当贝壳不再适应生存或者死去后，部分贝类的外壳仍然会留在原始位置上，附着在石头上。这一过程受地理位置的影响比较大。这些因素解释了为何在不同的地域和水域条件下石头上出现贝壳的现象会有所不同。

2. 在沉积岩形成的过程中，沉积物中的碳酸钙和其他成分会沉积成岩石，同时贝壳类生物的化石也会被一起封存。随着时间的流逝，当岩石风化露出埋藏的贝壳化石时，就会发现石头上有贝壳的情况。这类石头被大量挖掘作为古生物化石研究的重要来源。所以这也是石头上出现贝壳的一个原因。在极端的地质环境下，极端环境下的高压与热力有可能把一些有机物以压缩的形态深入到矿物结晶里一并保留下来形成特殊的生物化石，这种情况下也会有贝壳附着在石头上。

总的来说，石头上有贝壳是因为贝类生物与石头之间存在着紧密的联系和影响，具体表现为生物的繁殖和沉积物的积累等多重原因共同形成的现象。这一现象的存在也是海洋生态系统的一种反映。如果您遇到这种现象或有进一步的疑问可以请教专业人士寻求解答。