博士、硕士和本科论文之间的区别主要体现以下几方面：

1. 研究深度与广度：

* 博士论文：研究通常更为深入，需要具备创新性和解决重大问题的能力。研究内容通常涉及更高级或专业的领域，需要深入探讨某一特定主题或问题。

* 硕士论文：研究深度介于博士和本科之间，需要在研究主题或专业领域表现出专业知识和技能。需要完成较为完整的研究，展示自己的分析和研究能力。

* 本科论文：主要是对于所学知识进行综合性的梳理和总结，强调知识和技能的整合运用。一般不具备特别高的研究深度和原创性要求。

2. 研究目的：博士论文常常旨在推动某一领域的边界拓展，或者在某个专业领域达到重大发现；硕士论文的目的是对某一具体问题或主题进行全面的研究和分析；本科论文的目的更多在于实践和应用所学知识，进行一定的理论探讨和实践验证。

3. 研究内容与独立性要求：博士生需要进行创新性的研究和更详尽的分析和解释工作。他们需要独立思考、选题设计和规划，并完成整套实验和研究过程。硕士生的研究更多是对某个课题的全面探究和分析，也需要独立研究能力和学术素养。本科生的论文写作虽然也要求独立研究能力，但一般篇幅较短，研究内容和观点也通常限于课本知识的扩展或深化。在三者中，博士论文对独立性的要求最高。

综上所述，博士论文、硕士论文和本科论文在研究的深度、广度、目的以及独立性要求等方面存在显著差异。这些差异反映了不同学位层次在学术研究上的不同需求和标准。