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昭通师范高等专科学校计算机科学系创办于1995年，1999年经云南省教育厅批准，面向社会招生。

设有计算机应用技术和计算机信息管理两个专业。

计算机科学系现有专兼职教师28人，其中副教授6人，讲师11人，助教9人。

计算机科学系设有全国计算机等级考试昭通考点；计算机软件专业资格与水平考试报名点。

全国少儿计算机（少儿NIT）培训考试点；昭通市专业技术人员职称计算机培训及考试点。

2006年该系与西南大学联合开设“3+1”专升本对接办学模式，即在昭通师范高等专科学校教育系读三年，在西南大学读一年，通过各科考试，取得国家承认的本科学历及学士学位，享受同专业同学历同等待遇。

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